TP Traitement de l’image médicale

             Est exposée ci-dessous une liste de TP répondant aux objectifs de la matière. Chaque TP est lui-même composé en moyenne de 4 manips. Différentes. Les équipes de formation sont priées de réaliser au moins 4 TP (voire plus, si cela est possible) en fonction de la disponibilité du matériel pédagogique. Par ailleurs, il est permis de rajouter ou remplacer quelques TPs de la liste jointe par d’autres TP en relation avec la matière.

Précision :

 Tout changement apporté à cette liste doit être signalé au CPND de manière à en faire profiter les autres établissements.

  • TP1 : Introduction à MATLAB et aux librairies de traitement d’images
    1.  Représentation des images digitales sous MATLAB
    2. Traitements sur la couleur et la palette
    3. Manipulation de différentes images biomédicales
    4.  Etude comparative
    5.  Mise en évidence des artefacts et autres sources de dégradation
  • TP2 : Traitement numérique des images par MATLAB
    1. Prise en main des images de différents formats : lecture, écriture affichage
    2.  Transformations ponctuelles sur l’image
    3.  Traitement sur l’histogramme
    4. Transformations géométriques sur l’image
    5.  Applications sur des images médicales
  • TP3 : Prétraitements des images sous MATLAB
    1.  Masque moyenneur et filtrage spatial
    2.  Filtrage non linéaire (filtre médian)
    3.  FFT2D et filtrage fréquentiel
    4.  Modèles de bruits : débruitage des images
    5. Restauration des images
  • TP4 : Détection de contours et segmentation,
    1.  Exemple de certains masques de détection de contours
    2.  Seuillage d’images (différentes techniques)
    3.  Binarisation d’images et opérations morphologiques
    4.  Applications sur des images médicales
  • TP5 : Traitement des images morphologiques
    1. Quantification, correction de biais
    2. Reconstruction de volumes à partir de projections
    3. Segmentation des tissus
    4. Recalage multi sujets (études de groupe)
  • TP6 : Traitements des images fonctionnelles
    1.  Filtrage temporel :
      • débruitage,
      • élimination de dérives
      •  Analyse statistique des séquences d’images (3D+t)
    2. Segmentation fonctionnelle
    3. Recalage anatomo-fonctionnel multimodal
  • TP7 : Imagerie médicale 3D
    1. Reconstruction d’images (Echographie 3D, scanner X et/ou IRM)
    2. Visualisation 3D